Enklaavin alaisuudessa toimii tällä hetkellä kahdeksan eri jaostoa. Jaostot toimivat yhteistyössä hallituksen kanssa, ja niiden jäsenet pääsevät vaikuttamaan läheisesti Enklaavin toimintaan. Jaostoilla on äärimmäisen tärkeä rooli Enklaavin toiminnassa ja sen kehittymisessä. Tehtävät vaihtelevat kunkin jaoston mukaisesti, ja niiden tarkoituksena on mahdollistaa monipuolisempaa ja laadukkaampaa toimintaa Enklaavin jäsenille. Jaostojen puheenjohtajat istuvat myös Enklaavi ry:n hallituksessa ja huolehtivat näin saumattomasta yhteistyöstä.
Vuonna 2022 Enklaavin alaisuudessa tulee toimimaan maisteri-, yrityssuhde-, opinto-, tapahtuma-, media-, liikunta- ja vuosijuhlajaostot. Lisäksi talousvastaavan apuna toimii taloustoimihenkilö. Tarkemmat jaostokuvaukset löydät kunkin jaoston omalta sivulta.